2000年1月5日，绍兴文理学院元培学院经浙江省人民政府批准成立，为绍兴文理学院下属的国有民办本科二级学院，具有独立法人资格，实行相对独立办学，财务独立核算。2000年建院以来至2006年所形成的档案，作为二级学院归入教学类进行管理。随着学院办学规模的不断扩大，档案数量和类目越来越多，为便于查阅利用，从2007年形成的档案开始，元培学院作为一个全宗来管理，按照高校档案工作规范管理全宗。至2023年6月，逐步完善高校十大类档案，该全宗内有党群、行政、教学、科研、设备、财务及声像等类档案共10629卷。此全宗于2013年移出校档案馆，由元培学院保存管理。