绍兴卫校、绍兴建工中专、上虞师范学校三所学校于2000年先后并入绍兴文理学院。绍兴卫校并入前的永久、长期卷档案已移交给绍兴市档案馆保管，数字档案可在本校档案馆查阅。短期档案现保存在本校医学院办公室；绍兴建工中专并入前的永久、长期卷档案已移交给绍兴市档案馆保管，短期档案现保存在本校档案馆；上虞师范学校1989年以前永久保存的文书档案已移交给上虞市档案馆，1990年至并入前的永久、长期卷档案尚保存在上虞师范学校档案室，为确保全宗的完整，该部分档案拟择时移交给上虞市档案馆。